關於免疫如何發展如何幫助科學家保護世界所有動植物免受疾病的新見解
維爾德·萊帕特(Vilde Leipart)是挪威生命科學大學的研究員。她分享了自己的alphafold故事。
我對保護蜜蜂的需求很強烈。
蜜蜂是我們的文化和經濟不可或缺的,但最重要的是,對我們的生態系統是如此。許多物種的生存取決於它們作為傳粉媒介。但是在全球範圍內,由於環境因素和人類干擾,蜜蜂種群正在迅速下降。
為了增加他們的生存機會,我們需要研究蜜蜂免疫系統的基礎知識。我感興趣的領域是植物生成蛋白,這是您幾乎所有產卵的動物中都可以找到的蛋白質。它支持繁殖,但似乎也起著其他作用,包括免疫力和調節餵養行為。
植物蛋白可以像抗體一樣與病原體蛋白結合,並有助於在卵子上傳遞的免疫力。母親或女王攝入的細菌,真菌和病毒的碎片被轉移到發育中的卵中,它們會引發發育中的胚胎中的免疫力。在充滿傳染病的世界中,這種“跨代免疫啟動”是提高蜜蜂和許多其他物種的生存能力的關鍵。
使用X射線晶體學在1990年代後期對七lamp鼠葉片蛋白進行建模。但是,到目前為止,對Honeybee版本的結構知之甚少,Honeybee版本是一種很難繪製的蛋白質,主要是因為它很大。因此,我們著手使用Alphafold來理解它。
由於卵黃蛋白似乎扮演著許多角色,因此我們想可視化其功能特異性域,查看它們的相互作用,然後根據Alphafold揭示的結構對其不同功能進行預測。我從Alphafold創建的結構中學到了很多東西 – 我花了很多時間盯著它。我還在學習!我們能夠看到蛋白質的全長如何組裝和連接,以及蛋白質亞基如何相互作用。關鍵是我能夠迅速做到這一點。我花了兩天的時間做了可能花了很多年的事情。
這項工作也具有更廣泛的影響。雞蛋飼養物種包括樹蛙,雞,鱷魚,鬼鯊和海龜。它們都生成卵黃蛋白,並且都容易患有各種傳染病。了解其在蜜蜂中的基本功能可能會揭示其在其他動物中的作用,並通過此作用有助於保護脆弱的野生物種和家養動物免受傳染病和農藥的侵害。
我喜歡研究蜜蜂,並希望這項研究可以帶來保護該物種和其他物種的新方法。我在挪威生活和工作。在這裡,魚類和釣魚對我們的文化和經濟非常重要。魚類,尤其是商業養殖的魚 – 容易受到疾病爆發的影響,我想擴大研究以從事鮭魚植物素的研究,我希望有所作為。
Alphafold使這項工作成為可能,對如此廣泛的物種和場景具有影響,這確實令人興奮。